Nisan 2004’te Tokyo kenti, Japon Atletizm Federasyonu ile bir şehir maratonu yapmak için görüşmelere başlar, hedef 2005 yılıdır. Hedeflenen yılda Tokyo Şehri ve Japon Atletizm Federasyonu el sıkışır ancak ilk maraton 18 Şubat 2007 yılında düzenlenebilir. 2012 yılında yapılan 6. yarıştan sonra Tokyo Maratonu bildiğimiz 5 büyük şehir maratonunun yanına (Berlin, Londra, Boston, New York,…